Pracę rozpoczęła 2 VIII 1971 r. w Wojewódzkim Archiwum Państwowym w Bydgoszczy. Już wkrótce znalazła się w Inowrocławiu, gdzie od stycznia 1972 r. pełniła obowiązki, a od 19 VII 1973 r. objęła funkcję kierownika Oddziału. Przeszła wszystkie szczeble archiwalnej kariery, od młodszego archiwisty (1971) do starszego kustosza (1987).
W latach 1991-1997 była członkiem Centralnej Komisji Metodycznej. We wrześniu 1994 r. została powołana w skład międzyarchiwalnego zespołu naukowego w sprawie gromadzenia i opracowywania akt stanu cywilnego. Od 2 XI 1976 r. jest członkiem Komisji Metodycznej w AP w Bydgoszczy, a od 31 VII 1986 r. członkiem Komisji Archiwalnej Oceny Dokumentacji.
W listopadzie 1992 r. dr L. Wakuluk obroniła rozprawę doktorską na temat Akta miast Rejencji Bydgoskiej 1815-1919 przygotowaną pod kierunkiem prof. dra Bohdana Ryszewskiego (opublikowana w 1998 r.). Jest autorką Informatora o zasobie Oddziału w Inowrocławiu (1985) oraz wielu artykułów popularyzujących zasób archiwum zamieszczanych na łamach regionalnych czasopism historycznych i prasy codziennej.
Od wielu lat dr L. Wakuluk organizuje lub uczestniczy w przygotowaniu sesji i konferencji popularnonaukowych oraz bardzo różnorodnych tematycznie wystaw, na których eksponowane są archiwalia z zasobu Archiwum Inowrocławskiego. W latach 1974-2011 odbyło się ponad 40 wystaw. Dr Lidia Wakuluk aktywnie uczestniczy w pracach wielu organizacji społecznych. Od 1994 r. jest członkiem Miejskiego Komitetu Ochrony Pomników Walk i Męczeństwa w Inowrocławiu. Od wielu lat pełni funkcję członka zarządu, a od września 2004 r. do września 2010 r. była wiceprezesem Towarzystwa Miłośników Inowrocławia. Przez długie lata pełniła funkcję sekretarza Inowrocławskiego Oddziału Polskiego Towarzystwa Historycznego, a od 2005 r. przewodniczy Komisji Rewizyjnej. Od 2006 r. jest członkiem Rady Muzeum im. J. Kasprowicza w Inowrocławiu.
Za swoją pracę zawodową i działalność społeczną dr L. Wakuluk była wielokrotnie wyróżniana i odznaczana, m.in. odznaką honorową Za zasługi dla archiwistyki (1981), Brązowym (1978), Srebrnym (1988) oraz Złotym Krzyżem Zasługi (1993), Medalem Komisji Edukacji Narodowej (1998), odznaką honorową Zasłużony dla kultury polskiej (2006). W 1985 r. PMRN w Inowrocławiu przyznało dr L. Wakuluk medal pamiątkowy z okazji 800-lecia Inowrocławia. W 2005 r. została wyróżniona przez prezydenta m. Inowrocławia tytułem Animatora Kultury i udekorowana repliką zapinki celtyckiej.